Im November 2006 erhielt das AKW Temelin die baurechtliche Betriebsgenehmigung (Kollaudierung). Die im Rahmen des Anhang I des Melk-Abkommens aufgezählten Sicherheitsdefizite wurden bis zu diesem Zeitpunkt nicht beseitigt. Das Melk-Abkommen wurde daher verletzt.

Die österreichische Bundesregierung hat im Juni 2007 die Verletzung des Melk-Abkommens im Rahmen eines offiziellen Schreibens an die tschechische Regierung festgehalten. Anschließend wurde in Verhandlungen der beiden Regierungschefs die Einsetzung einer bilateralen parlamentarischen Kommission zur Behandlung des Melk-Abkommens vereinbart.

Die erste Sitzung der bilateralen Temelin-Kommission fand im Juli in Prag statt. Es wurde das hauptsächlich das Prozedere für die weitere Tätigkeit der Kommission vereinbart. Im Rahmen der zweiten Sitzung im September 2007 in Wien wurden die Meinungen der Experten beider Länder präsentiert und Expertenworkshops zu den offenen Fragen vereinbart. Im Rahmen der Workshops konnten einige der weniger relevanten Punkte des Melk-Abkommens abgeschlossen werden.

Im Rahmen der dritten Sitzung am 17. Dezember 2007 in Budweis stellte die tschechische Seite die völkerrechtliche Verbindlichkeit des Melk-Abkommens in Frage. Für die weitere Tätigkeit der Kommission gibt es bis zur Klärung dieser fundamentalen Frage keine Grundlage.

Im Rahmen des Anti-Atom-Gipfels des Landes Oberösterreich am 20. Dezember 2007 wurde die Klärung der völkerrechtlichen Verbindlichkeit des Melk-Abkommens zum zentralen Punkt erklärt, von dem die weitere Teilnahme an der Tätigkeit der Kommission abhängig sein soll. Zur Klärung sollte eine parteiübergreifende Entschließung im Nationalrat eingebracht werden. Ein Entwurf wurde allen NR-Abgeordneten aus Oberösterreich am 25. Jänner übermittelt.

Die Entschließung wurde von den Abgeordneten der Regierungskoalition leider nicht unterstützt. Trotz der ungeklärten Frage der völkerrechtlichen Verbindlichkeit des Melk-Abkommens nahmen die in der Kommission verbliebenen Abgeordneten der Fraktionen SPÖ und ÖVP an der abschließenden Sitzung der Kommission im Juni in Melk teil. Auch im Rahmen dieser Sitzung wurde kein Versuch unternommen, die zentrale Frage der völkerrechtlichen Verbindlichkeit zu klären. Die wichtigsten Sicherheitsprobleme bleiben auch nach Abschluss der Kommission ungelöst, zusätzlich wurde ein weiteres schwerwiegendes Sicherheitsproblem bekannt. Die Bundesregierung bleibt sowohl bei der Klärung der völkerrechtlichen Verbindlichkeit als auch bei der Einforderung der Behebung der Sicherheitsmängel untätig.